Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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