Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms