Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEUROD1Q13562 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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