Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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