Protein–RNA interactions for Protein: Q13231

CHIT1, Chitotriosidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIT1Q13231 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHIT1Q13231 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms