Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STRN3Q13033 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms