Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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