Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FOXF2Q12947 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FOXF2Q12947 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FOXF2Q12947 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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