Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TROQ12816 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TROQ12816 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TROQ12816 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TROQ12816 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TROQ12816 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TROQ12816 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TROQ12816 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TROQ12816 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
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