Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFEMP1Q12805 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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EFEMP1Q12805 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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