Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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