Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms