Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms