Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms