Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms