Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms