Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms