Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms