Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms