Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms