Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms