Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms