Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREMQ03060 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREMQ03060 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms