Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms