Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ID3Q02535 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms