Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms