Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTCQ00610 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms