Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms