Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP1P63208 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP1P63208 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP1P63208 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP1P63208 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP1P63208 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP1P63208 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP1P63208 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP1P63208 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms