Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-24P63145 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms