Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms