Protein–RNA interactions for Protein: P59797

SELENOV, Selenoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOVP59797 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOVP59797 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOVP59797 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOVP59797 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOVP59797 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOVP59797 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOVP59797 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms