Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms