Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms