Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP98P52948 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP98P52948 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP98P52948 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP98P52948 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP98P52948 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms