Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLK1P49759 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLK1P49759 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLK1P49759 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLK1P49759 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLK1P49759 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms