Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GGCXP38435 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms