Protein–RNA interactions for Protein: P34096

RNASE4, Ribonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4P34096 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNASE4P34096 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms