Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBP1P32455 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBP1P32455 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBP1P32455 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms