Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCAP28676 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms