Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD1P28340 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD1P28340 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD1P28340 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD1P28340 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD1P28340 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms