Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPREP23469 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPREP23469 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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