Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms