Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1P21675 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1P21675 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1P21675 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF1P21675 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms