Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NTF3P20783 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NTF3P20783 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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