Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD53P19397 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD53P19397 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD53P19397 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD53P19397 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD53P19397 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD53P19397 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD53P19397 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms