Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms