Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms