Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms