Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms